"Mê Cung Long Ẩn - Detective Dee" xoay quanh cuộc phiêu lưu đầy kịch tính của nhân vật chính, Địch Nhân Kiệt. Khi một vụ án bí ẩn liên quan đến "thuyền ma" xảy ra tại cảng Hồng Kông, ông chủ của nơi này đã tìm cách tự bảo vệ mình bằng cách sử dụng "Thủy tặc loạn". Tuy nhiên, Địch Nhân Kiệt không hề tin tưởng vào giải pháp này và cảm thấy có điều gì đó kỳ quặc đang diễn ra. Trong khi ngày lễ lớn sắp tới, người dân Trường An đang sống trong sự hoảng loạn do vụ án này gây ra, hoàng hậu đã ra lệnh cho Thần Minh - người đứng đầu Đại Lý Tự - phải giải quyết vụ án trong vòng ba ngày. Tuy nhiên, Thần Minh lại áp lực Địch Nhân Kiệt để anh ta phải giải quyết vụ án này.