Gintama.: Shirogane no Tamashii-hen - Kouhan-sen tiếp tục câu chuyện sau cuộc rút lui tạm thời của Quân đội Giải phóng Altana khỏi Quận Kabuki. Tình hình chiến tranh dường như đã được cải thiện, nhưng khi Oniwaban, Shinsengumi và cư dân của quận chiến đấu với tàn quân của quân đội, nhà phát minh vĩ đại nhất của Edo Gengai Hiraga bị bắt cóc. Trách nhiệm giờ đây reca trở nên nặng nề khi virus nanomachine của Gengai hiện có nguy cơ bị tắt, và anh ta phải tìm cách khiến kẻ thù phải rút lui trước khi mọi thứ trở nên tồi tệ hơn.