'Hắc Môn - Cuộc chiến bí ẩn' xoay quanh một vụ tai nạn xe buýt tưởng chừng như rất bình thường, nhưng lại khiến nhiều lực lượng vào cuộc. Đúng lúc mọi người đổ về hiện trường để điều tra sự thật, hàng loạt điều bất ngờ nổ ra, khơi dậy cuộc khủng hoảng ẩn sau vụ án chưa được giải quyết. Những biến cố đen tối và âm mưu không ngờ đã làm rung chuyển cả thành phố, khiến mọi người không biết ai là kẻ thủ ác và ai là kẻ hùng mạnh trong cuộc chiến này. Với những manh mối mới được tiết lộ, khán giả sẽ được trải qua những giây phút căng thẳng và hồi hộp, từ từ tiếp cận sự thật đen tối của câu chuyện này.