Hương Vị Của Em Gái Nhỏ xoay quanh câu chuyện về Mi-na, người thích mát-xa và ngưỡng mộ kỹ năng của nhà trị liệu Hyeon-goo. Mi-na quyết định giới thiệu Hyeon-goo với người em gái thân thiết của mình, So-hee. Ban đầu, So-hee miễn cưỡng khi gặp Hyeon-goo nhưng sau đó đã phải lòng kỹ năng mát-xa của anh chàng này. Cuộc gặp gỡ này đã dẫn đến một tình huống lãng mạn khi Mi-na đưa ra lời cầu hôn mới với So-hee và Hyeon-goo. Điểm nhấn của bộ phim là sự phát triển các mối quan hệ giữa các nhân vật chính và cách họ khám phá tình yêu trong cuộc sống hàng ngày.