Moshidora xoay quanh Minami tham gia đội bóng chày trường trung học của cô ấy với tư cách là người quản lý đội sau khi biết rằng người bạn thân nhất của cô ấy là Yuuki đang nằm viện và không thể làm quản lý đội nữa. Để cố gắng thay thế Yuuki và giúp đỡ đội hết sức có thể, cô ấy đã ra ngoài tìm một cuốn sách về cách quản lý một đội bóng chày. Với sự kiên trì và nỗ lực, Minami đã phải học cách điều hành một nhóm người, xây dựng chiến thuật cho đội bóng và vượt qua các khó khăn để giúp đội tiến xa trong giải đấu. Moshidora không chỉ mang lại câu chuyện về bóng chày mà còn là câu chuyện về tình bạn, sự tự tin và lòng quyết tâm vượt qua khó khăn để đạt được mục tiêu.