Murenase! Seton Gakuen kể về cuộc sống tại Học viện Seton, nơi mà đa dạng loài động vật tụ tập. Jin Mazama là một học sinh không hề ưa thích động vật, nhưng mọi thứ bắt đầu thay đổi khi anh gặp Ranka Ookami - một cô gái con sói đơn độc không có bạn bè hay gia đình xung quanh. Đồng hành cùng nhau, họ sẽ trải qua nhiều trải nghiệm thú vị và học hỏi lẫn nhau trong môi trường học tập mới lạ này.