Nàng Mariko Vụn Vỡ Của Tôi kể về Tomoyo Shiino, một nhân viên văn phòng bình thường. Một ngày định mệnh, cô phải đối diện với thông tin bi thảm về cái chết tự sát của người bạn thân Mariko Ikagawa. Họ từng là bạn học cùng trường và Tomoyo biết rõ nỗi đau mà Mariko phải chịu đựng từ việc bị cha lạm dụng suốt nhiều năm. Để cứu rỗi linh hồn của Mariko, Tomoyo quyết định chiếm đoạt hài cốt của cô từ gia đình người bạn đã ra đi. Trên con đường tìm lại những ký ức và tình bạn đã mất, Tomoyo bắt đầu cuộc hành trình kỳ lạ cùng với bạn mới - hài cốt của Mariko.