Protocol sắc mưa của chúng ta kể về cuộc đời của Tokinoya Shun, một học sinh cao trung năm hai đầy nhiệt huyết. Sau cú sốc từ tai nạn giao thông khiến cha mất và em gái bị tàn tật, Shun buộc phải từ bỏ niềm đam mê với game. Hiện tại, anh làm việc tại quán cà phê esports FOX ONE, cố gắng cân bằng giữa việc học, làm thêm và thời gian dành cho game cùng người bạn thân từ thuở nhỏ.