"Puff: Rạn San Hô Kỳ Diệu" xoay quanh cuộc phiêu lưu của một chú cá nóc con, khi nó đang du hành qua một thế giới vi mô kỳ diệu với những sinh vật kỳ ảo. Chú cá nóc con đầy tò mò này có mục tiêu là tìm kiếm một ngôi nhà trên Rạn san hô Great Barrier, nơi có sự sống phong phú và đa dạng. Trong hành trình của mình, Puff sẽ gặp gỡ những loài sinh vật độc đáo và khám phá những bí ẩn của rạn san hô, từ các cấu trúc tự nhiên tuyệt đẹp cho đến các hiện tượng sinh thái phức tạp. Với sự giúp đỡ của bạn bè mới và khả năng thích ứng linh hoạt của mình, Puff sẽ trải qua những thử thách để tìm ra ngôi nhà lý tưởng trong xanh của rạn san hô này.