Sakurada Reset là câu chuyện về Kei Asai, một cậu học sinh sống ở thành phố ven biển Sakurada nơi mà mọi người sinh ra với những khả năng siêu nhiên đặc biệt. Trong một ngày bình thường, Kei gặp Misora Haruki trên sân thượng của trường. Misora có khả năng thiết lập lại mọi thứ xung quanh cô cho đến ba ngày trước. Hai người họ bắt đầu cuộc phiêu lưu tìm hiểu về quá khứ và những bí ẩn của Sakurada, nơi mà sức mạnh siêu nhiên không phải lúc nào cũng mang lại niềm vui và hạnh phúc.